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SNP芯片

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Affymetrix SNP芯片

产品描述信息

  单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism, SNP) 是在单个的核苷酸上发生变异而引起的DNA序列多态性,多为转换和颠换两种。SNP作为第三代遗传标记,数量众多、分布广泛、易于检测,是理想的基因分型目标。SNP分型检测在疾病基因组、遗传育种、群体进化、药物基因组学、诊断学、生物医药研究等领域具有重大意义。

 

  基于Affymetrix 公司GeneChip和GeneTitan平台的全基因组SNP芯片既可用于全基因组SNP分析,又可用于CNV分析。

产品详细信息

 

 

 

基于GeneChip平台的人SNP 6.0 芯片的实验流程

 

 

 

芯片推荐

芯片名称

物种

SNP位点数

应用

Genome-Wide Human SNP

906,600

(1)全基因组关联研究(GWAS)

Axiom®CHB1& CHB2

中国人

130

(1)最大限度覆盖稀有和常见变异,专为中国人群设计

Axiom® Exome

35,000

(1)最完整的外显子组基因分型芯片,可筛查功能变异,了解疾病相关性

Axiom® Porcine

658,692

(1)高分辨率遗传图谱的构建

(2)纯系的遗传改良

(3)数量性状位点(QTL)的精细定位

(4)训练群体的开发,利用基因组选择模型计算育种值

Axiom® Buffalo

水牛

90,000

分子育种

复杂性状研究

保护生物多样性

Axiom® BOS1

>640,000

(1)全基因组关联研究(GWAS)

(2)生物多样性

(3)连锁不平衡(LD)研究

Axiom® Chicken

580,961

(1)蛋鸡和肉鸡育种价值的预测

(2)全基因组关联研究

(3)高分辨率遗传作图和孟德尔性状作图

(4)选择特征分析

Axiom® equine

>670,000

(1)全基因组关联研究

(2)高分辨率遗传作图和孟德尔性状作图

(3)多样性分析和选择特征分析

Axiom® Salmon

鲑鱼/三文鱼

>130,000

(1)复杂性状研究:GWASQTL精细定位研究

(2)分子育种:关联作图和性别鉴定等

(3)群体与进化遗传学:区分不同产地的鱼类品种以及区分养殖和野生种群

Axiom® Trout

虹鳟鱼

57,501

(1)复杂性状研究和分子育种:GWAS和数量性状位点(QTL)作图、重要经济性状的鉴定、通过基因组选择改善水产养殖育种计划的准确性

(2)群体和进化遗传学:区分不同来源的鱼类、性别鉴定、区分养殖和野生的群体

Axiom® Maize

玉米

609,442 SNP和6,759 个插入/缺失

(1)复杂性状的研究:遗传多样性分析、关联作图全基因组分析和选择、玉米多样性的单倍型研究、LD分析和QTL精细作图

(2)分子育种:开发新的品系和基因组选择

Axiom® Wheat reeder

小麦

817,000

(1)分子育种--优质小麦品系培育:基因组选择、标记辅助选择、渗入基因(Introgressed genes)的检测、种质资源鉴定和高通量筛选

Axiom® Wheat HD

小麦

817,000

(1)全球六倍体小麦品系

(2)复杂性状研究

Axiom® Cotton

棉花

35,550

(1)复杂性状研究:开展GWAS和精细作图和鉴定有经济意义的性状

(2)分子育种:开展关联作图、提高育种计划的效率和培育棉花的新品种

Axiom® Soybean

大豆

180,961

(1)基因组结构和复杂性状研究:开展GWAS和精细作图、确定具有经济价值的性状、构建高分辨率的遗传图谱和检测基因组结构的自然变异

(2)分子育种:在大豆育种项目中开展关联定位和基因组选择

(3)群体和进化遗传学:区分不同来源的大豆群体、 区分栽培种和野生种的群体

Axiom® Strawberry

草莓

95,062

(1)复杂性状的研究:QTL发现以及鉴定具有经济价值的性状

(2)分子育种:全基因组扫描、分子标记辅助育种

(3)新品种的发布:加快和提高品种开发的效率、鉴定现有的草莓种质资源中存在的重要标记、利用遗传信息来确定将在特定种植区表现良好的种质

Axiom® Rose

玫瑰

68,893

(1)复杂性状研究:多倍体连锁图谱、后代和育种材料中多个SNP单倍型的鉴定、用于发现与重要表型性状(如抗病能力)相关联的标记单倍型的QTL分析

(2)分子育种:单倍型辅助选择和杂交亲本的单倍型选择、加速和提高品种开发的效率


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