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客户发表文章简介--微生物领域
作者: 来源: 发布于:2016-5-23 15:43:10 点击量:

细菌基因组测序
长双歧杆菌通过适应性进化增强耐酸性:耐酸突变体和野生型的基因比较分析 (合作发表)
Jiang Y, Ren F, Liu S, et al. Enhanced Acid Tolerance in Bifidobacterium longum by Adaptive Evolution: Comparison of the genes between the acid-resistant variant and wild-type strain[J]. Journal of microbiology andbiotechnology, 2015.
酸胁迫是对长双岐杆菌具有严重破坏性质的环境压力。为了利用自适应进化学方法提高长双歧杆菌BBMN68菌株的耐酸性,研究人员在一定条件下对BBMN68菌株进行培养,从5个时间点获得的克隆株中分离耐酸突变体,利用基因组测序技术并结合表型分析对BBMN68耐酸突变菌株和野生菌株的表型和基因组差异进行研究,同时利用qRT-PCR技术检测EPS合成关键基因cpsD的表达情况。结果分析表明, BBMN68菌株的耐酸性提高, 突变菌株中鉴定出19SNPs,其中6个基因的氨基酸序列发生了改变,而 EPS的变化可能是BBMN68m耐酸性的关键因素。上述结果为揭示长双歧杆菌耐酸的可能性机制提供了研究依据。

 

16S测序
从玉米中分离出携带nifH基因的类芽孢杆菌新种 (合作发表)
Gao J, Lv F, Wang X, et al. Paenibacillus wenxiniae sp. nov., a nifH gene-harbouring endophytic bacterium isolated from maize[J]. Antonie van Leeuwenhoek, 2015, 108(5): 1015-1022.
  类芽孢杆菌属隶属于类芽孢杆菌科,到目前为止,该属已正式命名的种有150个之多。它们可生存的环境很多,比如空气、碱性土、发酵物、湿地、温泉、沉积物、根瘤等。在调查研究玉米内生固氮菌多样性的过程中,我们发现了类芽孢杆菌属的一个新种,暂命名为373 T。研究人员采集玉米抽雄期根部组织,在缺氮培养基上培养分离373 T菌株(P. hunanensis DSM 22170T 菌株为对照),随后利用16S测序技术进行分析。基于数据分析,研究人员构建了373 T及其近缘种的系统进化树,并对nifH基因序列进行了系统进化分析; 确定373T菌种是类芽孢杆菌属近缘种的表型分化,目前已被提议定名为Paenibacillus wenxiniae sp. nov.



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